高斯混合模型训练 (GmmTrainBatchOp)

Java 类名:com.alibaba.alink.operator.batch.clustering.GmmTrainBatchOp

Python 类名:GmmTrainBatchOp

功能介绍

混合模型(Mixture Model)是一个可以用来表示在总体分布中含有K个子分布的概率模型。换句话说,混合模型表示了观测数据在总体中的概率分布,它是一个由K个子分布组成的混合分布。
而高斯混合模型(Gaussian Mixture Model, GMM)可以用来表示在总体分布中含有K个高斯子分布的概率模型。它通常可以被用作分类模型。

参数说明

名称 中文名称 描述 类型 是否必须? 取值范围 默认值
vectorCol 向量列名 向量列对应的列名 String 所选列类型为 [DENSE_VECTOR, SPARSE_VECTOR, STRING, VECTOR]
epsilon 收敛阈值 当两轮迭代的中心点距离小于epsilon时,算法收敛。 Double 1.0E-4
k 聚类中心点数量 聚类中心点数量 Integer 2
maxIter 最大迭代步数 最大迭代步数,默认为 100 Integer x >= 1 100
randomSeed 随机数种子 随机数种子 Integer 0

代码示例

Python 代码

from pyalink.alink import *

import pandas as pd

useLocalEnv(1)

df_data = pd.DataFrame([
    ["-0.6264538 0.1836433"],
    ["-0.8356286 1.5952808"],
    ["0.3295078 -0.8204684"],
    ["0.4874291 0.7383247"],
    ["0.5757814 -0.3053884"],
    ["1.5117812 0.3898432"],
    ["-0.6212406 -2.2146999"],
    ["11.1249309 9.9550664"],
    ["9.9838097 10.9438362"],
    ["10.8212212 10.5939013"],
    ["10.9189774 10.7821363"],
    ["10.0745650 8.0106483"],
    ["10.6198257 9.9438713"],
    ["9.8442045 8.5292476"],
    ["9.5218499 10.4179416"],
])

data = BatchOperator.fromDataframe(df_data, schemaStr='features string')
dataStream = StreamOperator.fromDataframe(df_data, schemaStr='features string')

gmm = GmmTrainBatchOp() \
    .setVectorCol("features") \
    .setEpsilon(0.)

model = gmm.linkFrom(data)

predictor = GmmPredictBatchOp() \
    .setPredictionCol("cluster_id") \
    .setVectorCol("features") \
    .setPredictionDetailCol("cluster_detail")

predictor.linkFrom(model, data).print()

predictorStream = GmmPredictStreamOp(model) \
    .setPredictionCol("cluster_id") \
    .setVectorCol("features") \
    .setPredictionDetailCol("cluster_detail")

predictorStream.linkFrom(dataStream).print()

StreamOperator.execute()

Java 代码

import org.apache.flink.types.Row;

import com.alibaba.alink.operator.batch.BatchOperator;
import com.alibaba.alink.operator.batch.clustering.GmmPredictBatchOp;
import com.alibaba.alink.operator.batch.clustering.GmmTrainBatchOp;
import com.alibaba.alink.operator.batch.source.MemSourceBatchOp;
import com.alibaba.alink.operator.stream.StreamOperator;
import com.alibaba.alink.operator.stream.clustering.GmmPredictStreamOp;
import com.alibaba.alink.operator.stream.source.MemSourceStreamOp;
import org.junit.Test;

import java.util.Arrays;
import java.util.List;

public class GmmTrainBatchOpTest {
	@Test
	public void testGmmTrainBatchOp() throws Exception {
		List <Row> df_data = Arrays.asList(
			Row.of("-0.6264538 0.1836433"),
			Row.of("-0.8356286 1.5952808"),
			Row.of("0.3295078 -0.8204684"),
			Row.of("0.4874291 0.7383247"),
			Row.of("0.5757814 -0.3053884"),
			Row.of("1.5117812 0.3898432"),
			Row.of("-0.6212406 -2.2146999"),
			Row.of("11.1249309 9.9550664"),
			Row.of("9.9838097 10.9438362"),
			Row.of("10.8212212 10.5939013"),
			Row.of("10.9189774 10.7821363"),
			Row.of("10.0745650 8.0106483"),
			Row.of("10.6198257 9.9438713"),
			Row.of("9.8442045 8.5292476"),
			Row.of("9.5218499 10.4179416")
		);
		BatchOperator <?> data = new MemSourceBatchOp(df_data, "features string");
		StreamOperator <?> dataStream = new MemSourceStreamOp(df_data, "features string");
		BatchOperator <?> gmm = new GmmTrainBatchOp()
			.setVectorCol("features")
			.setEpsilon(0.);
		BatchOperator <?> model = gmm.linkFrom(data);
		BatchOperator <?> predictor = new GmmPredictBatchOp()
			.setPredictionCol("cluster_id")
			.setVectorCol("features")
			.setPredictionDetailCol("cluster_detail");
		predictor.linkFrom(model, data).print();
		StreamOperator <?> predictorStream = new GmmPredictStreamOp(model)
			.setPredictionCol("cluster_id")
			.setVectorCol("features")
			.setPredictionDetailCol("cluster_detail");
		predictorStream.linkFrom(dataStream).print();
		StreamOperator.execute();
	}
}

运行结果

features cluster_id cluster_detail
-0.6264538 0.1836433 1 4.275273913968281E-92 1.0
-0.8356286 1.5952808 1 1.0260377730239899E-92 1.0
0.3295078 -0.8204684 1 1.0970173367545207E-80 1.0
0.4874291 0.7383247 1 3.302173132311E-75 1.0
0.5757814 -0.3053884 1 3.1638113605165424E-76 1.0
1.5117812 0.3898432 1 2.101805230873173E-62 1.0
-0.6212406 -2.2146999 1 6.772270268600749E-97 1.0
11.1249309 9.9550664 0 1.0 3.156783801247968E-56
9.9838097 10.9438362 0 1.0 1.9024447346702425E-51
10.8212212 10.5939013 0 1.0 2.800973098729604E-56
10.9189774 10.7821363 0 1.0 1.7209132744891298E-57
10.0745650 8.0106483 0 1.0 2.8642696635130495E-43
10.6198257 9.9438713 0 1.0 5.773273991940433E-53
9.8442045 8.5292476 0 1.0 2.5273123050925483E-43
9.5218499 10.4179416 0 1.0 1.7314580596767853E-46

备注

资源如何预估

  • 每个worker的内存大小如何估计?
  • 假设聚类中心点数量为K,输入数据的维度为m,那么每个worker需要的memory可以设置为(m * m * k * 8 * 2 * 12) ~ 200km\^2,转换为MB之后是(200km\^2 / 1024 / 1024). 一般来说,设置每个worker 8GB即可。
  • 如何设置worker的个数?
  • 建议按照输入数据的大小设置。假设输入数据为{X}GB,那么建议使用{5X}个worker。如果资源不够使用,可以适当降低worker数目。随着worker数目的增加,由于通信开销的存在,分布式训练任务会先变快,然后变慢。用户如果观测到worker数目增加之后,速度变慢,那么应该停止增加worker数目。
  • 本算法可以支持多大的数据量?
    • 建议向量维度小于200。