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Alink教程

Alink组件列表

Alink教程(Java版)
教程内容补充、答疑及勘误
附录
该文档涉及的组件

第25.7节 运行ONNX模型

ONNX(Open Neural Network Exchange，开放神经网络交换)是为人工智能模型（深度学习和传统ML）提供的一种开放格式，可使模型在不同框架之间进行转移。详见 https://github.com/onnx/onnx


Alink提供了OnnxModelPredictBatchOp、OnnxModelPredictStreamOp和OnnxModelPredictor组件，分别处理批式场景、流式场景和进行Pipeline封装。

各组件都需要指定 ONNX 模型的modelPath模型路径参数。模型路径可以是以下形式：

  • 本地文件：file:// 加绝对路径，例如 file:///tmp/dnn.py；
  • Java 包中的资源文件：res:// 加路径，例如 res:///dnn.py；
  • http/https 文件：http:// 或 https:// 路径；
  • OSS 文件：oss:// 加路径和 Endpoint 和 access key
    等信息，例如oss://bucket/xxx/xxx/xxx.py?host=xxx&access_key_id=xxx&access_key_secret=xxx；
  • HDFS 文件：hdfs:// 加路径；


参与模型预测的数据通过参数 selectedCols 设置，需要注意以下几点：

  • ONNX 模型使用 input name 来标识模型输入桩的，因此需要设置 inputNames，与 selectedCols 一一对应，表明某列对应某输入桩。inputNames 不填写时，默认与列名一致。
  • 仅支持输入桩为 Tensor 类型，不支持 Sequences 和 Maps 类型。
  • 所选择的列的类型需要是float, double, int, long, byte, string 类型及其对应的 Alink Tensor 类型。

模型输出信息通过参数 outputSchemaStr 指定，包括输出列名以及名称，需要注意以下几点：

  • ONNX 模型使用 output name 来标识模型输出桩的，因此需要设置 outputNames，与 outputSchemaStr 一一对应，表明某列对应某输入桩。outputNames 不填写时，默认与列名一致。
  • 仅支持输出桩为 Tensor 类型，不支持 Sequences 和 Maps 类型。
  • outputSchemaStr 填写的输出类型需要是对应的输出桩类型，例如 输出桩类型 为 Float 类型的 Tensor 时，对应的 Alink 类型可以是 TENSOR 或者 FLOAT_TENSOR，当输出仅包含一个元素时，还可以是 FLOAT。

组件使用的是 ONNX 1.11.0 版本，当有 GPU 时，自动使用 GPU 进行推理，否则使用 CPU 进行推理。

25.7.1 批式任务中使用ONNX模型


使用OnnxModelPredictBatchOp组件，可以加载ONNX模型进行批式预测。关于该组件的详细说明参见Alink文档 https://www.yuque.com/pinshu/alink_doc/onnxmodelpredictbatchop .

使用ONNX模型前，还需要将输入数据列的类型转换为Tensor格式，可以使用VectorToTensorBatchOp组件。具体代码如下所示：

new AkSourceBatchOp()
	.setFilePath(Chap13.DATA_DIR + Chap13.DENSE_TEST_FILE)
	.link(
		new VectorToTensorBatchOp()
			.setTensorDataType("float")
			.setTensorShape(1, 1, 28, 28)
			.setSelectedCol("vec")
			.setOutputCol("tensor")
			.setReservedCols("label")
	)
	.link(
		new OnnxModelPredictBatchOp()
			.setModelPath(
				"https://alink-release.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/data-files/cnn_mnist_pytorch.onnx")
			.setSelectedCols("tensor")
			.setInputNames("0")
			.setOutputNames("21")
			.setOutputSchemaStr("probabilities FLOAT_TENSOR")
	)
	.link(
		new UDFBatchOp()
			.setFunc(new GetMaxIndex())
			.setSelectedCols("probabilities")
			.setOutputCol("pred")
	)
	.lazyPrint(3)
	.link(
		new EvalMultiClassBatchOp()
			.setLabelCol("label")
			.setPredictionCol("pred")
			.lazyPrintMetrics()
	);

BatchOperator.execute();

这里用到了一个自定义函数，具体定义如下：

public static class GetMaxIndex extends ScalarFunction {

	public int eval(FloatTensor tensor) {
		int k = 0;
		float max = tensor.getFloat(0, 0);
		for (int i = 1; i < 10; i++) {
			if (tensor.getFloat(0, i) > max) {
				k = i;
				max = tensor.getFloat(0, i);
			}
		}
		return k;
	}
}


批式任务的运行结果为：

label|tensor|probabilities|pred
-----|------|-------------|----
0|FloatTensor(1,1,28,28)          |FloatTensor(1,10)                                                 |0
 |[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[0.0 -1434.9991 -1350.7235 ... -1287.3451 -1404.4778 -1434.9991]]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   ...                          |
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 | ... ...                        |
9|FloatTensor(1,1,28,28)          |FloatTensor(1,10)                                                |9
 |[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-1105.8378 -1105.8378 -1105.8378 ... -1105.8378 -732.2857 0.0]]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   ...                          |
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 | ... ...                        |
1|FloatTensor(1,1,28,28)          |FloatTensor(1,10)                                              |1
 |[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-1503.7417 0.0 -1402.91 ... -1180.878 -1370.2913 -1503.7417]]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   ...                          |
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 | ... ...                        |
-------------------------------- Metrics: --------------------------------
Accuracy:0.9904	Macro F1:0.9904	Micro F1:0.9904	Kappa:0.9893	
|Pred\Real|  9|  8|   7|...|   2|   1|  0|
|---------|---|---|----|---|----|----|---|
|        9|988|  3|   3|...|   0|   0|  0|
|        8|  1|962|   0|...|   1|   0|  1|
|        7|  6|  2|1014|...|   3|   0|  1|
|      ...|...|...| ...|...| ...| ...|...|
|        2|  0|  2|   3|...|1021|   0|  0|
|        1|  3|  0|   6|...|   3|1134|  0|
|        0|  2|  4|   0|...|   1|   0|978|

25.7.2 流式任务中使用ONNX模型


使用OnnxModelPredictStreamOp组件，可以加载ONNX模型进行批式预测。关于该组件的详细说明参见Alink文档 https://www.yuque.com/pinshu/alink_doc/onnxmodelpredictstreamop .

使用ONNX模型前，还需要将输入数据列的类型转换为Tensor格式，可以使用VectorToTensorStreamOp组件。具体代码如下所示：

new AkSourceStreamOp()
	.setFilePath(Chap13.DATA_DIR + Chap13.DENSE_TEST_FILE)
	.link(
		new VectorToTensorStreamOp()
			.setTensorDataType("float")
			.setTensorShape(1, 1, 28, 28)
			.setSelectedCol("vec")
			.setOutputCol("tensor")
			.setReservedCols("label")
	)
	.link(
		new OnnxModelPredictStreamOp()
			.setModelPath("https://alink-release.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/data-files/cnn_mnist_pytorch"
				+ ".onnx")
			.setSelectedCols("tensor")
			.setInputNames("0")
			.setOutputNames("21")
			.setOutputSchemaStr("probabilities FLOAT_TENSOR")
	)
	.link(
		new UDFStreamOp()
			.setFunc(new GetMaxIndex())
			.setSelectedCols("probabilities")
			.setOutputCol("pred")
	)
	.sample(0.001)
	.print();

StreamOperator.execute();

运行结果为：

label|tensor|probabilities|pred
-----|------|-------------|----
5|FloatTensor(1,1,28,28)          |FloatTensor(1,10)                                                        |5
 |[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-1679.8259 -1679.8259 -1679.8259 ... -1679.8259 -1399.0499 -1008.8595]]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   ...                          |
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 | ... ...                        |
8|FloatTensor(1,1,28,28)          |FloatTensor(1,10)                                              |8
 |[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-565.4354 -879.83417 -691.5988 ... -898.3416 0.0 -784.97516]]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   ...                          |
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 | ... ...                        |
7|FloatTensor(1,1,28,28)          |FloatTensor(1,10)                                               |7
 |[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-1642.872 -1219.6741 -818.6717 ... 0.0 -1427.4896 -1179.5854]]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   ...                          |
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 | ... ...                        |

......

25.7.3 Pipeline中使用ONNX模型

学习了如何在批式任务和流式任务中使用ONNX模型，我们很容易在Pipeline中使用ONNX模型进行预测，只要将其中的批式/流式组件对应到Pipeline组件即可。具体代码如下：

new PipelineModel(
	new VectorToTensor()
		.setTensorDataType("float")
		.setTensorShape(1, 1, 28, 28)
		.setSelectedCol("vec")
		.setOutputCol("tensor")
		.setReservedCols("label"),
	new OnnxModelPredictor()
		.setModelPath("https://alink-release.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/data-files/cnn_mnist_pytorch.onnx")
		.setSelectedCols("tensor")
		.setInputNames("0")
		.setOutputNames("21")
		.setOutputSchemaStr("probabilities FLOAT_TENSOR")
).save(Chap13.DATA_DIR + PIPELINE_ONNX_MODEL, true);
BatchOperator.execute();

PipelineModel
	.load(Chap13.DATA_DIR + PIPELINE_ONNX_MODEL)
	.transform(
		new AkSourceStreamOp()
			.setFilePath(Chap13.DATA_DIR + Chap13.DENSE_TEST_FILE)
	)
	.link(
		new UDFStreamOp()
			.setFunc(new GetMaxIndex())
			.setSelectedCols("probabilities")
			.setOutputCol("pred")
	)
	.sample(0.001)
	.print();
StreamOperator.execute();

运行结果为：

label|tensor|probabilities|pred
-----|------|-------------|----
6|FloatTensor(1,1,28,28)          |FloatTensor(1,10)                                                       |6
 |[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-1234.3433 -1670.8674 -1670.8674 ... -1670.8674 -1384.003 -1670.8674]]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   ...                          |
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 | ... ...                        |
7|FloatTensor(1,1,28,28)          |FloatTensor(1,10)                                                |7
 |[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-615.27924 -152.31528 -290.78244 ... 0.0 -575.1346 -499.75998]]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   ...                          |
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 | ... ...                        |
1|FloatTensor(1,1,28,28)          |FloatTensor(1,10)                                                 |1
 |[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-1557.5773 0.0 -1557.5773 ... -1363.7996 -1293.8707 -1557.5773]]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 |   ...                          |
 |   [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
 | ... ...                        |

......

25.7.4 LocalPredictor中使用ONNX模型


除了通过Alink任务使用ONNX模型，也可以使用LocalPredictor进行嵌入式预测。示例代码如下，首先从数据集中抽取一行数据，输入数据的SchemaStr为“vec string, label int”；然后通过导入上一节保存的Pipeline模型，并设置输入数据的SchemaStr，得到LocalPredictor类型的实例localPredictor；如果不确定预测结果各列的含义，可以打印输出localPredictor的OutputSchema；使用localPredictor的map方法获得预测结果。

AkSourceBatchOp source = new AkSourceBatchOp()
	.setFilePath(Chap13.DATA_DIR + Chap13.DENSE_TEST_FILE);

System.out.println(source.getSchema());

Row row = source.firstN(1).collect().get(0);

LocalPredictor localPredictor
	= new LocalPredictor(Chap13.DATA_DIR + PIPELINE_ONNX_MODEL, "vec string, label int");

System.out.println(localPredictor.getOutputSchema());

Row r = localPredictor.map(row);
System.out.println(r.getField(0).toString() + " | " + r.getField(2).toString());

localPredictor.close();

运行结果为：

root
 |-- vec: STRING
 |-- label: INT

root
 |-- label: INT
 |-- tensor: LEGACY(GenericType<com.alibaba.alink.common.linalg.tensor.FloatTensor>)
 |-- probabilities: LEGACY(GenericType<com.alibaba.alink.common.linalg.tensor.FloatTensor>)

1 | FloatTensor(1,10)
[[-1503.7417 0.0 -1402.91 ... -1180.878 -1370.2913 -1503.7417]]